Cal Cruchlow ha logrado el mejor tiempo de MotoGP en el tercer entrenamiento libre en Brno, en una sesión en la que las Yamaha han estado muy arriba, con Jorge Lorenzo, segundo, y Valentino Rossi, cuarto. Las Honda oficiales se han situado en el tercer (Marc Márquez) y quinto puesto (Dani Pedrosa). Buenos entrenamientos también para Álvaro Bautista, sexto, seguido del rookie Bradley Smith, quien ha terminado por delante de Stefan Bradl, de Andrea Dovizioso y de Nicky Hayden.
| POS | PILOTO | MOTO | TIEMPO/DIF |
| 1 | C.CRUTCHLOW | YAMAHA | 1'56.156 |
| 2 | J.LORENZO | YAMAHA | 0.166 |
| 3 | M.MARQUEZ | HONDA | 0.210 |
| 4 | V.ROSSI | YAMAHA | 0.330 |
| 5 | S.BRADL | HONDA | 0.344 |
| 6 | D.PEDROSA | HONDA | 0.444 |
| 7 | A.BAUTISTA | HONDA | 0.765 |
| 8 | B.SMITH | YAMAHA | 0.800 |
| 9 | A.DOVIZIOSO | DUCATI | 1.040 |
| 10 | N.HAYDEN | DUCATI | 1.386 |
| 11 | A.IANNONE | DUCATI | 1.706 |
| 12 | A.ESPARGARO | ART | 2.054 |
| 13 | H.BARBERA | FTR | 2.218 |
| 14 | C.EDWARDS | FTR KAWASAKI | 2.665 |
| 15 | C.CORTI | FTR KAWASAKI | 2.690 |
| 16 | Y.HERNANDEZ | ART | 2.717 |
| 17 | H.AOYAMA | FTR | 2.740 |
| 18 | M.PIRRO | DUCATI | 2.802 |
| 19 | R.DE PUNIET | ART | 3.138 |
| 20 | D.PETRUCCI | IODA-SUTER | 3.563 |
| 21 | M.LAVERTY | PBM | 4.182 |
| 22 | K.ABRAHAM | ART | 4.245 |
| 23 | M.BAUER | S&B SUTER | 4.565 |
| 24 | B.STARING | FTR HONDA | 5.050 |
| 25 | L.PESEK | IODA-SUTER | 5.183 |