La sesión inaugural del Gran Premio de Italia ha terminado con en Alex Rins lo más alto de la hoja de tiempos, seguido de Jack Miller y de Alex Márquez. El pupilo de Emilio Alzamora ha marcado un mejor crono 1:58.757, dos décimas más rápido que el establecido por el líder del Mundial y casi tres más veloz que el firmado por su compañero de equipo.
En cuarto lugar ha concluido otra Honda, la de Efrén Vázquez. El bilbaíno se ha situado por delante de un sorprendente Brad Binder (quinto) y de Miguel Oliveira (sexto) en el arranque de la sexta prueba de la temporada. Niccoló Antonelli, el primer piloto italiano clasificado, ha sido séptimo; mientras que Juanfran Guevara se ha colocado en la octava plaza.
Los integrantes del SKY Racing Team VR46, Francesco Bagnaia y Romano Fenati, han cerrado el ‘top ten’.
Clasificaciones
| Posición | Piloto | Marca | Tiempo/Dif. |
| 1 | Alex RINS | HONDA | 1'58.757 |
| 2 | Jack MILLER | KTM | 0.238 |
| 3 | Alex MARQUEZ | HONDA | 0.288 |
| 4 | Efren VAZQUEZ | HONDA | 0.629 |
| 5 | Brad BINDER | MAHINDRA | 0.651 |
| 6 | Miguel OLIVEIRA | MAHINDRA | 0.707 |
| 7 | Niccolò ANTONELLI | KTM | 0.847 |
| 8 | Juanfran GUEVARA | KALEX KTM | 0.955 |
| 9 | Francesco BAGNAIA | KTM | 1.003 |
| 10 | Romano FENATI | KTM | 1.017 |
| 11 | Alexis MASBOU | HONDA | 1.026 |
| 12 | Zulfahmi KHAIRUDDIN | HONDA | 1.039 |
| 13 | Danny KENT | HUSQVARNA | 1.249 |
| 14 | Niklas AJO | HUSQVARNA | 1.317 |
| 15 | Philipp OETTL | KALEX KTM | 1.326 |
| 16 | Enea BASTIANINI | KTM | 1.368 |
| 17 | John MCPHEE | HONDA | 1.408 |
| 18 | Jakub KORNFEIL | KTM | 1.460 |
| 19 | Hafiq AZMI | KTM | 1.837 |
| 20 | Andrea LOCATELLI | MAHINDRA | 1.937 |
| 21 | Livio LOI | KALEX KTM | 2.024 |
| 22 | Arthur SISSIS | MAHINDRA | 2.224 |
| 23 | Karel HANIKA | KTM | 2.251 |
| 24 | Alessandro TONUCCI | MAHINDRA | 2.296 |
| 25 | Matteo FERRARI | MAHINDRA | 2.556 |
| 26 | Scott DEROUE | KALEX KTM | 2.719 |
| 27 | Luca GRÜNWALD | KALEX KTM | 2.754 |
| 28 | Isaac VIÑALES | KTM | 2.942 |
| 29 | Eric GRANADO | KTM | 3.018 |
| 30 | Anthony GROPPI | FTR HONDA | 3.201 |
| 31 | Ana CARRASCO | KALEX KTM | 3.395 |
| 32 | Jules DANILO | MAHINDRA | 3.408 |
| 33 | Bryan SCHOUTEN | MAHINDRA | 3.980 |
| 34 | Gabriel RAMOS | KALEX KTM | 4.543 |
| 35 | Simone MAZZOLA | FTR HONDA | 4.709 |