Jonas Folger ha comenzado de la mejor manera posible el Gran Premio de Indianápolis de Moto3 al lograr el mejor tiempo en una primera sesión marcada por la aparición de la lluvia en los últimos instantes de la misma. Folger ya tenía la mejor vuelta cuando a falta de algo más de diez minutos se sacaba la bandera de agua, y los pilotos decidían volver a boxes. Pero sólo fueron unas gotas y todos ellos volvían a pista, teniendo tiempo el alemán para bajar si tiempo anterior. Isaac Viñales ha sido segundo, seguido de Alex Rins y Maverick Viñales.
| POS | PILOTO | MOTO | TIEMPO/DIF |
| 1 | Jonas FOLGER | KALEX KTM | 1'50.379 |
| 2 | Isaac VIÑALES | FTR HONDA | 0.446 |
| 3 | Alex RINS | KTM | 0.871 |
| 4 | Maverick VIÑALES | KTM | 1.044 |
| 5 | Alan TECHER | TSR HONDA | 1.200 |
| 6 | Jack MILLER | FTR HONDA | 1.258 |
| 7 | Niccolò ANTONELLI | FTR HONDA | 1.335 |
| 8 | Alex MARQUEZ | KTM | 1.661 |
| 9 | Efren VAZQUEZ | MAHINDRA | 1.844 |
| 10 | Arthur SISSIS | KTM | 1.991 |
| 11 | Eric GRANADO | KALEX KTM | 2.063 |
| 12 | Zulfahmi KHAIRUDDIN | KTM | 2.174 |
| 13 | Romano FENATI | FTR HONDA | 2.192 |
| 14 | Alessandro TONUCCI | FTR HONDA | 2.198 |
| 15 | Luis SALOM | KTM | 2.283 |
| 16 | Niklas AJO | KTM | 2.355 |
| 17 | Brad BINDER | SUTER HONDA | 2.365 |
| 18 | Jasper IWEMA | KALEX KTM | 3.178 |
| 19 | Miguel OLIVEIRA | MAHINDRA | 3.238 |
| 20 | Jakub KORNFEIL | KALEX KTM | 3.585 |
| 21 | Alexis MASBOU | FTR HONDA | 3.833 |
| 22 | Toni FINSTERBUSCH | KALEX KTM | 3.861 |
| 23 | Matteo FERRARI | FTR HONDA | 4.130 |
| 24 | Livio LOI | KALEX KTM | 4.152 |
| 25 | John MCPHEE | FTR HONDA | 4.347 |
| 26 | Lorenzo BALDASSARRI | FTR HONDA | 4.554 |
| 27 | Francesco BAGNAIA | FTR HONDA | 4.604 |
| 28 | Hyuga WATANABE | FTR HONDA | 4.647 |
| 29 | Florian ALT | KALEX KTM | 5.157 |
| 30 | Juanfran GUEVARA | TSR HONDA | 6.250 |
| 31 | Philipp OETTL | KALEX KTM | 7.369 |
| 32 | Jules DANILO | SUTER HONDA | 7.767 |
| 33 | Ana CARRASCO | KTM | 13.153 |