Pese a que todavía no hay nada oficial, sí sabemos que el equipo nipón intentó atar a Jonathan renovando su contrato una temporada más, pero finalmente éste zanjó el asunto ingresando en la escuadra británica STR para correr en 2013. Este equipo privado, donde compartirá cartel con el letonio Matiss Karro, cuenta con el apoyo incondicional de KTM fábrica y, supuestamente, será donde Barragán tratará de mejorar los magníficos resultados de obtuvo para la firma austriaca antes de irse a Kawasaki en 2010.
También es cierto que tuvo una suculenta oferta por parte de un equipo japonés, HM Honda, para correr en enduro. Sin embargo, el de Perales del Río decidió seguir, como mínimo un año más, en MX. Una decisión incentivada por su principal patrocinador, Red Bull, que seguirá con él un año más. Las obligaciones de Jonathan estarán, en un principio, en el campeonato inglés; un campeonato donde deberá lidiar con pilotos de la talla de Leok, Simpson, Ramon, Searle o Anstie. Sin embargo, no descarta correr en alguna prueba de nuestro Nacional si el calendario lo permite.