La carrera de Moto3 en Motegi se ha desarrollado como se esperaba, en grupo y sin decidir su ganador hasta pocos metros antes de la linea de meta. En esta ocasión ese grupo se formaba con siete pilotos, Jonas Folger, Danny Kent, Luis Salom, Zulfahmi Khairuddin, Maverick Viñales, Alessandro Tonucci y Sandro Cortese, que tenía posibilidades de salir campeón de Motegi. Sin embargo, las cosas se iban a complicar para algunos, especialmente para el piloto italo alemán.
Así las cosas, una vez pasado el ecuador de la carrera, la cabeza de ésta iba cambiando de manos vertiginosamente. Kent se encontraba con fuerzas para conseguir su primera victora, pero al mismo tiempo Folger y Salom esperaban tener su oportunidad y Cortese ganaba y perdía posiciones estudiando un panorama en el que la resolución del título para él pasaba por un mal resultado de los pilotos que le siguen la clasificación, caso de Salom y Viiñales. Éste último evidenciaba claros problemas para mantenerse entre los más rápidos.
El desenlace comenzaría a gestarse a dos vueltas del final, cuando Folger era líder y Salom atacaba la segunda posición. El español forzaba la situación y perdía adherencia, llevándose consigo al suelo Folger.
Este lance dejaba a Cortese, Kent, Tonucci y Viñales disputando la victoria. Con Salom fuera de carrera y Viñales en las posiciones traseras del grupo de cabeza, Cortese era nuevo líder y esa posición le valía para ser campeón, pero antes debía vérselas con su compañero Kent y un desatado Tonucci.
Cuando los tres pilotos llegaban al último ángulo del circuito tanto Kent como Tonucci pasaban a Cortese, pero éste intentaría una trazada distinta para recuperar la posición sobre Tonucci a la salida del viraje. Sin embargo, sus trazadas se encontraban y Cortese impactaba de lleno contra Tonucci y su moto. Cortese se iba al suelo mientras Tonucci luchaba no arrollarle. Finalmente Tonucci salvaría la caída y Cortese conseguía mantener el motor de su KTM en marcha, por lo que reiniciaba la marcha aunque ya sin ninguna posibilidad de ser campeón, ya que Viñales entraba finalmente segundo en meta y mantiene todavía posibilidades matemáticas de ser campeón.
Así, el podio quedaba compuesto por Kent, Viñales y Tonucci, entrando Cortese sexto en meta. El tiítulo deberá esperar.
Clasificación Carrera Moto3
| 1 | Danny KENT | KTM | 40'02.775 |
| 2 | Maverick VIÑALES | FTR HONDA | 40'03.035 |
| 3 | Alessandro TONUCCI | FTR HONDA | 40'05.127 |
| 4 | Alex RINS | SUTER HONDA | 40'06.179 |
| 5 | Zulfahmi KHAIRUDDIN | KTM | 40'06.420 |
| 6 | Sandro CORTESE | KTM | 40'16.169 |
| 7 | Miguel OLIVEIRA | SUTER HONDA | 40'18.298 |
| 8 | Louis ROSSI | FTR HONDA | 40'18.514 |
| 9 | Efren VAZQUEZ | FTR HONDA | 40'18.721 |
| 10 | Romano FENATI | FTR HONDA | 40'18.904 |
| 11 | Arthur SISSIS | KTM | 40'18.998 |
| 12 | Niccolò ANTONELLI | FTR HONDA | 40'19.146 |
| 13 | Niklas AJO | KTM | 40'31.143 |
| 14 | Alex MARQUEZ | SUTER HONDA | 40'31.150 |
| 15 | Jakub KORNFEIL | FTR HONDA | 40'31.284 |
| 16 | Hyuga WATANABE | HONDA | 40'33.846 |
| 17 | Adrian MARTIN | FTR HONDA | 40'43.067 |
| 18 | Kenta FUJII | TSR HONDA | 40'45.597 |
| 19 | Jack MILLER | HONDA | 40'45.671 |
| 20 | Alan TECHER | TSR HONDA | 40'50.226 |
| 21 | John McPHEE | KRP HONDA | 40'51.020 |
| 22 | Luca AMATO | KALEX KTM | 40'51.134 |
| 23 | Isaac VIÑALES | FTR HONDA | 40'51.214 |
| 24 | Josep RODRIGUEZ | FGR HONDA | 41'06.537 |
| 25 | Giulian PEDONE | SUTER HONDA | 41'13.065 |
| 26 | Danny WEBB | MAHINDRA | 41'13.259 |
| 27 | Yuudai KAMEI | HONDA | 40'35.455 |
