El parón de verano no ha cambiado las cosas, al menos, para el conjunto Ducati-Stoner-Bridgestone que han vuelto ha lograr el mejor registro en los entrenamientos cronometrados. Stoner ha logrado la pole con un 1’56.884, un tiempo un poco bajo respecto al 1’56.191 que marcó Valentino Rossi el año pasado una situación que pone de manifiesto las diferencias entre las actuales 800 cc y las antiguas MotoGP de 990 cc que se ha hecho patente en este circuito checo.
El actual campeón del mundo, Nicky Hayden, ha regresado de las vacaciones muy motivado y con ganas de dejar atrás la mala actuación del Gran Premio de Laguna Seca, dónde se cayó en la primera curva viéndose obligado a retirase. Hayden ha marcado la segunda mejor posición a 0.280 sg de Casey Stoner.
Dani Pedrosa completa la primera línea de parrilla. El español ha luchado duro para lograr un buen resultado y no parece que la Honda haya mejorado mucho en este descanso de verano.
El cuarto mejor registro ha ido a parar a manos de Hopkins, que se iba al suelo a pocos minutos del final del entrenamiento cuando rodaba en tiempos de pole position.
Randy DePuniet nos sorprendía en los últimos momentos marcando el quinto mejor tiempo cuando la bandera a cuadros que daba por finalizada la tanda ya había salido a pista. El francés le arrebataba la plaza a un Valentino Rossi que no ha destacado en ningún momento y que sólo se ha acercado a los puestos de cabeza cuando ha montado los neumáticos de clasificiación.
Carlos Checa finalizaba en la 12º posición por delante de Alex Barros y Toni Elías, que lograba una 14º posición que sabe victoria si tenemos en cuenta las difíciles condiciones físicas del piloto manresano.
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| Pos. | Piloto | Marca | Tiempo | Dif. | V.Máx. |
| 1 | Casey STONER | DUCATI | 1'56.884 | 291.6 | |
| 2 | Nicky HAYDEN | HONDA | 1'57.164 | 0.280 | 289.2 |
| 3 | Dani PEDROSA | HONDA | 1'57.179 | 0.295 | 290.9 |
| 4 | John HOPKINS | SUZUKI | 1'57.567 | 0.683 | 283.7 |
| 5 | Randy DE PUNIET | KAWASAKI | 1'57.599 | 0.715 | 286.0 |
| 6 | Valentino ROSSI | YAMAHA | 1'57.640 | 0.756 | 284.4 |
| 7 | Loris CAPIROSSI | DUCATI | 1'57.665 | 0.781 | 289.6 |
| 8 | Chris VERMEULEN | SUZUKI | 1'57.699 | 0.815 | 284.1 |
| 9 | Colin EDWARDS | YAMAHA | 1'57.702 | 0.818 | 281.7 |
| 10 | Sylvain GUINTOLI | YAMAHA | 1'57.732 | 0.848 | 282.9 |
| 11 | Shinya NAKANO | HONDA | 1'57.969 | 1.085 | 282.6 |
| 12 | Carlos CHECA | HONDA | 1'58.143 | 1.259 | 282.8 |
| 13 | Alex BARROS | DUCATI | 1'58.204 | 1.320 | 288.1 |
| 14 | Toni ELIAS | HONDA | 1'58.264 | 1.380 | 286.1 |
| 15 | Makoto TAMADA | YAMAHA | 1'58.399 | 1.515 | 283.2 |
| 16 | Anthony WEST | KAWASAKI | 1'59.386 | 2.502 | 285.7 |
| 17 | Kurtis ROBERTS | KR212V | 1'59.446 | 2.562 | 280.7 |
| 18 | Ivan SILVA | DUCATI | 1'59.721 | 2.837 | 286.0 |
