Brad Binder no pudo celebrar en Motegi su recién adquirido título de Moto3 con una nueva victoria. El sudafricano acarició la que hubiera sido su sexta victoria del curso, pero en el último giro se vio sorprendido por Enea Bastianini, quien le birló el triunfo por tan solo 17 milésimas.
En la salida, Migno, aprovechando la pole, tomó la delantera. Pero el liderato no le duró demasiado al italiano, pues en la frenada de la curva 11 se coló y Binder aprovechó su error para ponerse en cabeza. El flamante campeón no se lo pensó demasiado y nada más colocarse al frente tiró para romper el grupo. Lo consiguió, siendo Bastianini, Bagnaia, Ono y el propio Migno los únicos que pudieron seguir su ritmo. Unos giros después, era Bulega quien se unía al grupo, aunque el transalpino en ningún momento pudo entrar en la pelea. Sí lo hizo su compatriota Bastianini, quien puso contra las cuerdas al sudafricano. Binder parecía que las tenía todas consigo. Llegó a escaparse más de medio segundo, pero el transalpino, que no ganaba desde el GP de San Marino del año pasado, le atrapó a falta de tres vueltas. En la última, y de nuevo en la 11, llegó el adelantamiento de la victoria. Se trata del primer triunfo del año para ‘La Bestia’, que se venga de esta manera del resultado de la prueba sanmarinense de esta misma temporada, cuando sucedió justo lo contrario y Binder le arrebató la primera plaza.
“Para mí era todo o nada. En la ultima vuelta, en la recta, he apretado muchísimo. He frenado mucho más tarde y la ultima curva ha sido increíble. Binder estaba muy cerca de mí, pero al final he ganado yo”.
Nicolo Bulega, tercero, completó el podio. El transalpino llegó a meta cuarto, por detrás de Ono, pero el japonés fue descalificado a posteriori por no alcanzar el peso mínimo requerido.
Navarro, nueva caída
Jorge Navarro no pudo completar una sola vuelta del GP de Japón. El valenciano se tocó con Joan Mir nada más apagarse el semáforo rojo y en la primera curva quedó en fuera de juego. Tras este nuevo cero, la lucha por el subcampeonato se le complica, más teniendo en cuenta que su máximo rival por este puesto, Bastianini, venció la prueba.
No fue el día de los españoles: Canet (por dos veces) y Guevara se fueron al suelo, Jorge Martín sufrió una salida de pista y Herrera, que se saltó la salida, tuvo que realizar un ride through. Mir, noveno, y Albert Arenas, décimo cuarto, fueron los únicos de los nuestros que puntuaron. Ambos ganaron plaza por la sanción a Ono.
Clasificación GP de Japón de Moto3
| Posición | Piloto | Marca | Tiempo/Dif. |
| 1 | Enea BASTIANINI | HONDA | 39'24.273 |
| 2 | Brad BINDER | KTM | 0.017 |
| 3 | Nicolo BULEGA | KTM | 4.002 |
| 4 | Philipp OETTL | KTM | 5.119 |
| 5 | Fabio DI GIANNANTONIO | HONDA | 6.288 |
| 6 | Francesco BAGNAIA | MAHINDRA | 7.739 |
| 7 | Livio LOI | HONDA | 7.749 |
| 8 | Fabio QUARTARARO | KTM | 8.344 |
| 9 | Joan MIR | KTM | 8.880 |
| 10 | Niccolò ANTONELLI | HONDA | 9.037 |
| 11 | Lorenzo DALLA PORTA | KTM | 12.332 |
| 12 | Adam NORRODIN | HONDA | 13.525 |
| 13 | Jakub KORNFEIL | HONDA | 18.818 |
| 14 | Albert ARENAS | PEUGEOT | 21.263 |
| 15 | Tatsuki SUZUKI | MAHINDRA | 21.291 |
| 16 | Jules DANILO | HONDA | 21.727 |
| 17 | Marcos RAMIREZ | MAHINDRA | 34.475 |
| 18 | Bo BENDSNEYDER | KTM | 39.950 |
| 19 | Khairul Idham PAWI | HONDA | 40.177 |
| 20 | Fabio SPIRANELLI | MAHINDRA | 46.804 |
| 21 | Lorenzo PETRARCA | MAHINDRA | 49.085 |
| 22 | Darryn BINDER | MAHINDRA | 52.570 |
| 23 | Maria HERRERA | KTM | 52.682 |
| 24 | Andrea MIGNO | KTM | 1'16.774 |
| 25 | Juanfran GUEVARA | KTM | 1'22.102 |
| 26 | Shizuka OKAZAKI | HONDA | 1'51.623 |
