Tito Rabat volvió a demostrar la primera jornada en Japón porqué es, actualmente, el mejor piloto de la parrilla de Moto2. El español finalizó el viernes en Motegi como el más veloz, después de exhibir un ritmo espectacular en ambas sesiones de libres. En la primera acabó segundo, tras calcar el crono de Thomas Luthi (1'51.899); Ya en la segunda, el líder de la clase apretó un poco más y descendió del minuto y cincuenta y un segundos (1'50.990). Fue el único que pudo hacerlo. El segundo clasificado, Johann Zarco, finalizó a tres décimas; mientras que el tercero, Maverick Viñales lo hizo a más de medio segundo.
Su máximo rival y compañero de equipo, Mika Kallio, acabó séptimo y bastante lejos: a casi un segundo. El finlandés se vio rebasado por Aegerter (cuarto), Julián Simón (quinto) y Thomas Luthi (sexto).
Axel Pons, Sandro Cortese y Takaaki Nakagami completaron el top ten.
Clasificación combinada
| Posición | Piloto | Marca | Tiempo/Dif. |
| 1 | E.RABAT | KALEX | 1'50.990 |
| 2 | J.ZARCO | CATERHAM SUTER | 1'51.313 |
| 3 | M.VIÑALES | KALEX | 1'51.573 |
| 4 | D.AEGERTER | SUTER | 1'51.593 |
| 5 | J.SIMON | KALEX | 1'51.880 |
| 6 | T.LUTHI | SUTER | 1'51.895 |
| 7 | M.KALLIO | KALEX | 1'51.956 |
| 8 | A.PONS | KALEX | 1'52.068 |
| 9 | S.CORTESE | KALEX | 1'52.169 |
| 10 | T.NAKAGAMI | KALEX | 1'52.225 |
| 11 | F.MORBIDELLI | KALEX | 1'52.250 |
| 12 | M.SCHROTTER | TECH 3 | 1'52.273 |
| 13 | L.ROSSI | KALEX | 1'52.352 |
| 14 | S.LOWES | SPEED UP | 1'52.400 |
| 15 | H.SYAHRIN | KALEX | 1'52.470 |
| 16 | J.TORRES | SUTER | 1'52.581 |
| 17 | X.SIMEON | SUTER | 1'52.636 |
| 18 | N.TEROL | SUTER | 1'52.652 |
| 19 | M.PASINI | KALEX | 1'52.660 |
| 20 | R.WILAIROT | CATERHAM SUTER | 1'52.683 |
| 21 | L.SALOM | KALEX | 1'52.699 |
| 22 | R.CARDUS | TECH 3 | 1'52.87 |
| 23 | G.REA | SUTER | 1'52.953 |
| 24 | J.FOLGER | KALEX | 1'52.975 |
| 25 | A.WEST | SPEED UP | 1'52.997 |
| 26 | R.KRUMMENACHER | SUTER | 1'53.125 |
| 27 | L.BALDASSARRI | SUTER | 1'53.137 |
| 28 | F.MARINO | KALEX | 1'53.157 |
| 29 | A.SHAH | KALEX | 1'53.341 |
| 30 | R.RUSSO | SUTER | 1'53.591 |
| 31 | Y.TAKAHASHI | MORIWAKI | 1'53.643 |
| 32 | T.KOYAMA | NTS | 1'53.774 |
| 33 | R.MULHAUSER | SUTER | 1'53.892 |
| 34 | T.WAROKORN | KALEX | 1'53.941 |
| 35 | R.RAMOS | SPEED UP | 1'54.000 |
| 36 | C.POLAMAI | TECH 3 | 1'54.451 |