Las Ducati empezaron muy fuerte el año, con la victoria de Loris Capirosi en Jerez, pero la mala suerte con las lesiones del piloto italiano y también del español Gibernau, sumado a los problemas de las Ducati para encontrar un neumático ideal para poner toda la potencia de la moto sobre el asfalto, como ha ocurrido en el pasado gran premio. Todo ello, ha impedido que proliferen los buenos resultados y ha propiciado que los dirigentes italianos miren hacia el futuro.
Tanto Capirosi como Gibernau finalizan contrato a finales de 2006 y, aunque el máximo responsable de Ducati, Livio Suppo sólo ha tenido palabras de elogio para sus pilotos, la marca italiana confirma su interés por Hayden poco después del que ya habían mostrado por pilotos de la talla de Casey Stoner, Marco Melandri o Jorge Lorenzo, aunque este último ha decidido permanecer en 250 c.c. una temporada más.
El estadounidense Hayden lleva cuatro temporadas en la categoría reina incluyendo la presente que, sin duda, está siendo la mejor, algo que Ducati no ha pasado por alto. A parte de lo estrictamente deportivo, Hayden sería un reclamo perfecto para el mercado americano, el más importante para sus ventas, las cuales han aumentado un 30% durante el presente ejercicio 2006. Nicky finaliza contrato en 2006 y además tiene una gran competencia en el equipo HRC con la presencia de Dani Pedrosa que cada vez va a más.