El viento y la lluvia, como ha ocurrido en MotoGP, ha impedido a la mayor parte de los pilotos mejorar los tiempos obtenidos en el día de ayer, en el que Luis Salom realizó el mejor tiempo de Moto3 del Gran Premio de Qatar de MotoGP. Hoy, el propio Salom ha vuelto a ser el más rápido, seguido a más de medio segundo de Alex Rins y Jonas Folger.
Jack Miller y Efrén Vázquez han cerrado el top 5, pero ambos a un segundo de Salom. Maverick Viñales continúa con su recuperación, pero aun así ha logrado ser séptimo.
| POS | PILOTO | MOTO | TIEMPO/DIF |
| 1 | L.SALOM | KTM | 2'07.341 |
| 2 | J.FOLGER | KALEX KTM | 0.292 |
| 3 | A.RINS | KTM | 0.627 |
| 4 | A.MARQUEZ | KTM | 1.010 |
| 5 | N.ANTONELLI | FTR HONDA | 1.202 |
| 6 | E.VAZQUEZ | MAHINDRA | 1.205 |
| 7 | B.BINDER | SUTER HONDA | 1.239 |
| 8 | N.AJO | KTM | 1.240 |
| 9 | M.VIÑALES | KTM | 1.261 |
| 10 | J.KORNFEIL | KALEX KTM | 1.270 |
| 11 | D.WEBB | SUTER HONDA | 1.425 |
| 12 | A.TECHER | TSR HONDA | 1.479 |
| 13 | M.OLIVEIRA | MAHINDRA | 1.636 |
| 14 | Z.KHAIRUDDIN | KTM | 1.732 |
| 15 | J.MILLER | FTR HONDA | 1.742 |
| 16 | I.VIÑALES | FTR HONDA | 1.806 |
| 17 | R.FENATI | FTR HONDA | 2.141 |
| 18 | J.McPHEE | FTR HONDA | 2.225 |
| 19 | A.MASBOU | FTR HONDA | 2.286 |
| 20 | J.IWEMA | KALEX KTM | 2.483 |
| 21 | E.GRANADO | KALEX KTM | 2.683 |
| 22 | A.SISSIS | KTM | 2.772 |
| 23 | A.TONUCCI | HONDA | 2.986 |
| 24 | J.GUEVARA | TSR HONDA | 3.310 |
| 25 | P.OETTL | KALEX KTM | 3.316 |
| 26 | T.FINSTERBUSC | KALEX KTM | 3.346 |
| 27 | F.BAGNAIA | FTR HONDA | 4.545 |
| 28 | M.FERRARI | FTR HONDA | 4.610 |
| 29 | F.ALT | KALEX KTM | 4.632 |
| 30 | L.BALDASSARRI | FTR HONDA | 4.982 |
| 31 | A.CARRASCO | KTM | 5.271 |
| 32 | H.WATANABE | HONDA | 6.106 |