El español Jorge Martín (Honda), con problemas en la segunda tanda de entrenamientos libres para el Gran Premio de Francia de Moto3 en el circuito de Le Mans, perdió la primera posición para caer hasta la octava plaza en una jornada en la que acabó líder el italiano Niccolo Antonelli (Honda).
Martín no pudo mejorar su registro matinal, 1:42.114, del que se quedó a 84 milésimas de segundo (1:42.198), en tanto que casi todos sus rivales conseguían una mejoría notable, como en el caso de Antonelli, quien pasó de la vigésima plaza por la mañana a convertirse en líder.
Paradójicamente, los dos primeros clasificados de la mañana, Jorge Martín y el checo Jakub Kornfeil (KTM), fueron dos de los cuatro pilotos, junto al argentino Gabriel Rodrigo y el italiano Dennis Foggia, que no lograron mejorar sus tiempos al final de la jornada por distintos motivos, mientras que otros, que no habían podido destacar en la primera tanda, como el español Arón Canet (Estrella Galicia 0'0 Honda), cambiaron sensiblemente su trayectoria y ganaron posiciones en la clasificación provisional, hasta llegar al sexto puesto en el caso de éste, el mejor español de la categoría.
Así, Niccolo Antonelli y a escasamente 48 milésimas de segundo, acabó el nipón Kaito Toba (Honda), con los también transalpinos Enea Bastianini (Honda) y Tony Arbolino (Honda), tras ellos. Arbolino fue el dominador inicial de la segunda tanda de entrenamientos libres de Moto3, en la que no se tardó demasiado en comenzar a bajar los tiempos matinales, aunque casi en todo momento se situaron al frente de la tabla los "habituales" aspirantes a la victoria en cada gran premio, a excepción de Martín, al que los cambios que realizaron sobre la moto en su equipo, no le gustaron demasiado y eso se trasladó a su rendimiento en pista.
Canet, que por la mañana no había pasado de una discreta decimoquinta plaza, mejoró notablemente por la tarde para ser sexto, con Jorge Martín octavo, sin mejorar, y Jaume Masiá (KTM), en la decimocuarta posición, con Marcos Ramírez (KTM) dos puestos más atrás y Albert Arenas (KTM), vigésimo. Alonso López, el segundo piloto de la escuadra cervecera Estrella Galicia 0'0, no tuvo un día muy afortunado y tanto por la mañana como por la tarde "cerró" su actuación con el "farolillo rojo" en la clasificación.
Clasificación FP2 Moto3 Le Mans 2018:
| Pos. | Piloto | País | Equipo | Moto | Tiempo | Diferencia 1st/Prev. |
| 1 | Niccolò ANTONELLI | ITA | SIC58 Squadra Corse | Honda | 1'42.596 | |
| 2 | Kaito TOBA | JPN | Honda Team Asia | Honda | 1'42.644 | 0.048 / 0.048 |
| 3 | Enea BASTIANINI | ITA | Leopard Racing | Honda | 1'42.773 | 0.177 / 0.129 |
| 4 | Tony ARBOLINO | ITA | Marinelli Snipers Team | Honda | 1'42.852 | 0.256 / 0.079 |
| 5 | Marco BEZZECCHI | ITA | Redox PruestelGP | KTM | 1'42.861 | 0.265 / 0.009 |
| 6 | Aron CANET | SPA | Estrella Galicia 0,0 | Honda | 1'42.980 | 0.384 / 0.119 |
| 7 | Fabio DI GIANNANTONIO | ITA | Del Conca Gresini Moto3 | Honda | 1'42.985 | 0.389 / 0.005 |
| 8 | Philipp OETTL | GER | Sudmetal Schedl GP Racing | KTM | 1'43.158 | 0.562 / 0.173 |
| 9 | Jorge MARTIN | SPA | Del Conca Gresini Moto3 | Honda | 1'43.198 | 0.602 / 0.040 |
| 10 | Andrea MIGNO | ITA | Angel Nieto Team Moto3 | KTM | 1'43.213 | 0.617 / 0.015 |
| 11 | Makar YURCHENKO | KAZ | CIP - Green Power | KTM | 1'43.269 | 0.673 / 0.056 |
| 12 | Nicolo BULEGA | ITA | SKY Racing Team VR46 | KTM | 1'43.308 | 0.712 / 0.039 |
| 13 | Jaume MASIA | SPA | Bester Capital Dubai | KTM | 1'43.316 | 0.720 / 0.008 |
| 14 | Tatsuki SUZUKI | JPN | SIC58 Squadra Corse | Honda | 1'43.331 | 0.735 / 0.015 |
| 15 | Marcos RAMIREZ | SPA | Bester Capital Dubai | KTM | 1'43.348 | 0.752 / 0.017 |
| 16 | Livio LOI | BEL | Reale Avintia Academy | KTM | 1'43.354 | 0.758 / 0.006 |
| 17 | Lorenzo DALLA PORTA | ITA | Leopard Racing | Honda | 1'43.419 | 0.823 / 0.065 |
| 18 | John MCPHEE | GBR | CIP - Green Power | KTM | 1'43.444 | 0.848 / 0.025 |
| 19 | Albert ARENAS | SPA | Angel Nieto Team Moto3 | KTM | 1'43.489 | 0.893 / 0.045 |
| 20 | Ayumu SASAKI | JPN | Petronas Sprinta Racing | Honda | 1'43.653 | 1.057 / 0.164 |
| 21 | Kazuki MASAKI | JPN | RBA BOE Skull Rider | KTM | 1'43.661 | 1.065 / 0.008 |
| 22 | Jakub KORNFEIL | CZE | Redox PruestelGP | KTM | 1'43.671 | 1.075 / 0.010 |
| 23 | Darryn BINDER | RSA | Red Bull KTM Ajo | KTM | 1'43.689 | 1.093 / 0.018 |
| 24 | Gabriel RODRIGO | ARG | RBA BOE Skull Rider | KTM | 1'43.719 | 1.123 / 0.030 |
| 25 | Dennis FOGGIA | ITA | SKY Racing Team VR46 | KTM | 1'43.806 | 1.210 / 0.087 |
| 26 | Nakarin ATIRATPHUVAPAT | THA | Honda Team Asia | Honda | 1'43.850 | 1.254 / 0.044 |
| 27 | Adam NORRODIN | MAL | Petronas Sprinta Racing | Honda | 1'43.916 | 1.320 / 0.066 |
| 28 | Alonso LOPEZ | SPA | Estrella Galicia 0,0 | Honda | 1'44.295 | 1.699 / 0.379 |
