Valentino Rossi (Yamaha) ha sido el piloto más rápido de los entrenamientos cronometrados del Gran Premio de Assen, ha logrado la pole. La primera fila de la parrilla de salida la completarán Dani Pedrosa (Honda) y Jorge Lorenzo (Yamaha), que se ha situado a tres décimas del tiempo de Valentino Rossi (1.36.823). Casey Stoner (Ducati) se ha quedado fuera de la primera fila, el piloto australiano mostró su enfado cuando se encontró con Loris Capirossi (Suzuki) en la que debería de haber sido su vuelta rápida.
La sorpresa la ha dado el buen rendimeinto de Dani Pedrosa que comentaba tras los entrenamientos que ha sufrido menos dolores que en el Gran Premio de Catalunya, y que esto le ha permitido rodar más rápido. También a Pedrosa le ha ayudado encontrar la rueda de Valentino Rossi cuando se estaba disputando la pole, lo que le ha servido para conseguir el segundo mejor tiempo.
Durante la sesión de entrenamientos Jorge Lorenzo ha ido a un ritmo espectacular, y sólo a cinco minutos del final de los entrenamientos ha tenido que ceder la primera posicion de los cronometrados ante Valentino Rossi.
Del resto de los españoles hay que destacarla décimo quinta posición de Toni Elías (Honda); Sete Gibernau (Ducati) ha terminado el 16º.
Clasificaciones Gran Premio de Assen
| Pos | Piloto | Marca | Tiempo | Dif | Vel |
| 1 | Valentino ROSSI | YAMAHA | 1'36.025 | 0 | 293.1 |
| 2 | Dani PEDROSA | HONDA | 1'36.110 | 0.085 | 296.9 |
| 3 | Jorge LORENZO | YAMAHA | 1'36.393 | 0.368 | 292.4 |
| 4 | Casey STONER | DUCATI | 1'36.633 | 0.608 | 292.7 |
| 5 | Colin EDWARDS | YAMAHA | 1'36.760 | 0.735 | 293.4 |
| 6 | Loris CAPIROSSI | SUZUKI | 1'36.953 | 0.928 | 291.7 |
| 7 | Chris VERMEULEN | SUZUKI | 1'37.194 | 1.169 | 292.3 |
| 8 | Andrea DOVIZIOSO | HONDA | 1'37.237 | 1.212 | 290.8 |
| 9 | James TOSELAND | YAMAHA | 1'37.323 | 1.298 | 287.6 |
| 10 | Randy DE PUNIET | HONDA | 1'37.473 | 1.448 | 294.4 |
| 11 | Alex DE ANGELIS | HONDA | 1'37.637 | 1.612 | 288.2 |
| 12 | Mika KALLIO | DUCATI | 1'37.749 | 1.724 | 294.5 |
| 13 | Nicky HAYDEN | DUCATI | 1'37.759 | 1.734 | 295.4 |
| 14 | Marco MELANDRI | KAWASAKI | 1'37.948 | 1.923 | 287.4 |
| 15 | Toni ELIAS | HONDA | 1'38.136 | 2.111 | 294.4 |
| 16 | Sete GIBERNAU | DUCATI | 1'38.453 | 2.428 | 290.3 |
| 17 | Niccolo CANEPA | DUCATI | 1'38.605 | 2.580 | 287.2 |
| 18 | Yuki TAKAHASHI | HONDA | 1'38.619 | 2.594 | 291.7 |
| 19 | Gabor TALMACSI | HONDA | 1'39.407 | 3.382 | 282.9 |
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